Esta jogabilidade mostra alguns dos novos agentes que possuem habilidades e estatísticas fixas, o que é outra grande mudança em relação aos títulos anteriores do XCOM. Querubim é um arrombador de portas com um escudo, Claymore é um especialista em explosivos com poderosas granadas de carga atrasada, Terminal é um médico de equipe e Shelter é um poderoso Psiônico.